Philippe Auguste la fit rebâtir ou restaurer avec l'argent confisqué aux juifs en 1182. Dubreuil et Malingre disent à tord que ce fut lui le fondateur. Dédiée qu'en 1445 par Denis Dumoulin, évêque de Paris
L'édifice fut rebâti au XVIème siècle. Une paroisse supplémentaire était devenue nécessaire devant l'accroissement du village Saint Marcel au XII, lequel était devenu un "bourg".
Le choeur est détruit et remplacé au XIIe. Il est dédicacé le 21 avril 1163 par le pape Alexandre III. Il y eut une première tentative de réforme au XVIème siècle
Il se trouvait extra muros. La tour du Temple fut bâtie en 1212 par Frère Hubert, trésorier de l'Ordre. Le Trésor royal fut conservé dans la tour du Temple dès la fin du 12ème jusqu'au 14ème.
La localisation est donnée par De Gaulle qui dit que l'hôpital et la chapelle étaient au coin de la rue de la Tissanderie et de la rue du Pourtour Saint-Gervais.
Il y a un internat. On y fait des études d' humanités. Fondé pour 18 écoliers, qui, pour gagner de l'argent, arrosaient d'eau bénite les corps de l'Hôtel Dieu
Quand l'église devient-elle collégiale? Peut-être dès le XIème. Première mention d'un chanoine à Saint-Merry en 1175. On ne sait pas exactement quand cette fonction collégiale débute.